Genetics and Genomics 저널 표지 디자인 서비스(GWAS)

Journal of Genetics and Genomics

3 February 2023

게놈 및 전사체 분석을 통해 홀스타인 젖소의 피하 지방 축적과 관련된 중요한 유전자를 식별할 수 있습니다.

Hailiang Zhang^a,1, Siyuan Mi^a,1, Luiz F. Brito^b, Lirong Hu^a, Lei Wang^a, Longgang Ma^a, Qing Xu^c, Gang Guo^d, Ying Yu^a,*, Yachun Wang^a,*

10.1016/j.jgg.2023.01.011

이 연구의 주요 목적은 게놈 및 전사체 데이터 세트를 통합하여 생산성이 높은 젖소의 피하 지방 침착을 조절하는 주요 후보 유전자를 식별하는 것입니다. 피하 지방 축적과 관련된 유전자를 식별하는 것을 목표로 하는 게놈 전체 연관 연구(GWAS)를 수행하는 데 총 1654마리의 유전자형이 지정된 홀스타인 젖소가 사용되었습니다. 이어서, 34마리 소의 RNA 시퀀싱 데이터와 피하 지방 침착의 소 생산량 편차를 기반으로 가중 유전자 공동발현 네트워크 분석(WGCNA)을 수행합니다. 마지막으로, 피하 지방 축적에 대한 극단적이고 다양한 표현형을 가진 12마리의 홀스타인 젖소에 대해 차등 발현(DE) mRNA, lncRNA 및 차등 대체 스플라이싱 유전자를 얻습니다. 모든 연구 결과를 통합하면 NID2, STARD3, UFC1, DEDD, PPP1R1B 및 USP21 유전자는 홀스타인 젖소의 피하 지방 침착 특성에 영향을 미치는 가장 중요한 후보 유전자로 간주됩니다.