Nucleic Acids Research
11 July 2022
변환 클러스터링 알고리즘 및 폴리리보솜 구조 프로파일링에서의 적용
Wenhong Jiang1, Jonathan Wagner2,3, Wenjing Du1, Juergen Plitzko4, Wolfgang Baumeister2, Florian Beck4 and Qiang Guo1,5
1 단백질 및 식물 유전자 연구 국가 핵심 실험실, 북경청화 생명과학 센터, 첨단 학제간 연구 아카데미, 북경대학교 생명과학부, 베이징 100871, 중국,
2 막스 플랑크 생화학 연구소, 구조 분자 생물학과, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Germany,
3 막스 플랑크 생화학 연구소, 세포 생화학부, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Germany,
4 CryoEM 기술, Max Planck 생화학 연구소, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Germany,
5 중국 베이징 창핑연구소
10.1093/nar/gkac547
저온 전자 단층 촬영 시료 준비, 전자 현미경 장비 및 이미지 처리 알고리즘의 개선으로 현장에서 거대분자의 구조 분석이 향상되었습니다. 개별 고분자에 대한 이러한 분석 외에도 혼잡한 세포 서식지에서 기능적으로 관련된 이웃과의 상호 작용에 대한 연구, 즉 '분자 사회학'은 생물학에서 근본적으로 중요합니다. 여기서는 NEMO-TOC(NEighboring Molecule TOpology Clustering) 알고리즘을 제시합니다. 우리는 유전자 발현에서 구성적 역할과 조절적 역할을 모두 수행하는 폴리리보솜의 검출 및 프로파일링을 위해 이 알고리즘을 최적화했습니다. 우리의 결과는 번역이 동기화될 가능성이 있는 여러 개의 비확률적 블록을 연결하여 폴리솜이 형성되는 모델을 제안합니다.
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